ส่วนพัฒนาและฟื้นฟูแหล่งน้ำ มีหน้าที่รับผิดชอบพัฒนา ดำเนินการ ส่งเสริม สนับสนุน พัฒนาเทคโนโลยี แบบแปลน และมาตรฐานต่างๆ ควบคุม กำกับ ติดตามประเมินผล โครงการอนุรักษ์และฟื้นฟูแหล่งน้ำ จัดทำทะเบียนแหล่งน้ำในพื้นที่ที่รับผิดชอบตลอดจนปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย